眼镜凯门鳄一般体长约1.2-2米，体长最大可达2.5米，初孵出来的幼鳄有20-25厘米长。眼镜凯门鳄嘴长，背面呈橄榄绿色，头部、身体、尾部上有个多深色斑纹，背部及尾部上则有深棕色或黑色的横带纹，肚皮的颜色则是纯米色或者浅黄色。初孵出来的幼鳄下颌两侧有淡色斑，长大到大约35厘米长时，这些斑纹会全部消失。
眼镜凯门鳄一般栖居于广泛的水域栖息地。在淡水生境和一些咸水生境中都发现有眼镜凯门鳄。通常首选水流缓慢的河流和湿地。在深水中和浅水中都可以找到它们，因为它们只需要足够的深度就可以淹没他们的身体。
眼镜凯门鳄于其一生中不同时期均有不同天敌。捕食鳄卵的动物包括有黑点双领蜥、发冠长脚鹰、食蟹狐、浣熊、长鼻浣熊和戴帽猴等。而以雏鳄和幼鳄为食的则有鲶鱼等食肉性鱼类、龟、鳄鱼、夜鹭、鹳、鹰、虎猫以及家猪等。美洲豹及森蚺就会捕食成年鳄鱼。
眼镜凯门鳄与其他鳄鱼一样，食物随年龄、季节及栖息地的不同而变化。幼鳄主要以无脊椎动物为食，特别是鞘翅目昆虫，也会进食螺、虾及蟹等水生动物。成年鳄则主要以脊椎动物为食，包括水生及陆生的脊椎动物。它们的捕食策略包括静伏不动，偷袭路过的陆生脊椎动物，于水中偷袭游近的鱼类与其他水生脊椎动物。此外，它们有时也用身体和尾巴驱赶鱼类到浅水处，或者于开阔的水体将鱼类驱赶到狭窄的岸边后再捕食。
眼镜凯门鳄的求爱行为包括跃出水面、炫耀尾巴，以及轻咬和摩擦头部与颈部等。它们于不同地点的造巢活动的高峰期也有不同，一般多在潮湿季节。它们的巢由叶子、小树枝、杂草以及泥堆成小丘状。雌性的眼镜凯门鳄每次产卵可达40枚，而整个孵化期雌性会有规律地关心和保护巢址。幼鳄出壳时发出叫声，雌性将巢挖开护送雏鳄进入水中，而有时雄鳄也协助。雌鳄也会用嘴帮助胚鳄破壳而出，并用嘴携带幼鳄进入水中。在野外最长的已知寿命估计在60岁左右，但是一般在30-40年。平均圈养寿命为20年，最低记录为24年。